Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Atp8b5A3FIN4 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Atp8b5A3FIN4 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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