Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf39A2RT81 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf39A2RT81 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf39A2RT81 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf39A2RT81 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf39A2RT81 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf39A2RT81 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf39A2RT81 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf39A2RT81 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf39A2RT81 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf39A2RT81 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf39A2RT81 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf39A2RT81 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf39A2RT81 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf39A2RT81 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf39A2RT81 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf39A2RT81 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf39A2RT81 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf39A2RT81 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf39A2RT81 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf39A2RT81 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf39A2RT81 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Rnf39A2RT81 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf39A2RT81 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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