Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms