Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms