Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms