Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms