Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms