Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms