Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

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Length 761 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Phtf1Q9QZ09 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Phtf1Q9QZ09 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Phtf1Q9QZ09 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Phtf1Q9QZ09 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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