Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

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Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Tgm1Q9JLF6 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Tgm1Q9JLF6 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Tgm1Q9JLF6 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Tgm1Q9JLF6 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Tgm1Q9JLF6 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms