Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

Predictions only

Length 4,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Tex33-202ENSMUST00000165170 1072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Gm6612-201ENSMUST00000170777 395 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Kif4-ps-202ENSMUST00000185083 652 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Gm18124-201ENSMUST00000210695 706 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 P2rx1-202ENSMUST00000092938 1119 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Gsdmcl2-202ENSMUST00000185391 796 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 4930546C10Rik-201ENSMUST00000025428 363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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SacsQ9JLC8 Tnnt3-213ENSMUST00000105952 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Tnnt3-215ENSMUST00000105954 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Tnnt3-216ENSMUST00000105955 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Tnnt3-218ENSMUST00000105958 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Gm16080-201ENSMUST00000152128 692 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 C130080G10Rik-204ENSMUST00000155185 954 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Tnnt3-225ENSMUST00000179658 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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SacsQ9JLC8 Gm39091-201ENSMUST00000206189 553 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Tnnt3-202ENSMUST00000078497 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Zfp655-204ENSMUST00000199003 601 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Fkbp6-202ENSMUST00000201534 1287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 AC159261.1-201ENSMUST00000222493 911 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Mir341-201ENSMUST00000093593 96 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Gm7833-201ENSMUST00000183288 990 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms