Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

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Length 549 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Nectin3Q9JLB9 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Nectin3Q9JLB9 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Nectin3Q9JLB9 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Nectin3Q9JLB9 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Nectin3Q9JLB9 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Nectin3Q9JLB9 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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Nectin3Q9JLB9 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Nectin3Q9JLB9 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Nectin3Q9JLB9 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Nectin3Q9JLB9 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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