Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Habp4Q9JKS5 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84 ms