Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKA5

Gpa33, Cell surface A33 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpa33Q9JKA5 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gpa33Q9JKA5 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms