Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tuba8Q9JJZ2 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms