Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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