Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Wdr61Q9ERF3 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
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