Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms