Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Csnk1dQ9DC28 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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