Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Swt1Q9DBQ9 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Swt1Q9DBQ9 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Swt1Q9DBQ9 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Swt1Q9DBQ9 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Swt1Q9DBQ9 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Swt1Q9DBQ9 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Swt1Q9DBQ9 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Swt1Q9DBQ9 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Swt1Q9DBQ9 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Swt1Q9DBQ9 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Swt1Q9DBQ9 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Swt1Q9DBQ9 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
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Swt1Q9DBQ9 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Swt1Q9DBQ9 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Swt1Q9DBQ9 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Swt1Q9DBQ9 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Swt1Q9DBQ9 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Swt1Q9DBQ9 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Swt1Q9DBQ9 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Swt1Q9DBQ9 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Swt1Q9DBQ9 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Swt1Q9DBQ9 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms