Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms