Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim23Q9DAL0 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms