Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Snx5Q9D8U8 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms