Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Derl3Q9D8K3 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Derl3Q9D8K3 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Derl3Q9D8K3 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Derl3Q9D8K3 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Derl3Q9D8K3 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Derl3Q9D8K3 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Derl3Q9D8K3 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Derl3Q9D8K3 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Derl3Q9D8K3 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Derl3Q9D8K3 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Derl3Q9D8K3 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Derl3Q9D8K3 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Derl3Q9D8K3 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Derl3Q9D8K3 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Derl3Q9D8K3 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Derl3Q9D8K3 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Derl3Q9D8K3 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Derl3Q9D8K3 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Derl3Q9D8K3 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Derl3Q9D8K3 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Derl3Q9D8K3 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Derl3Q9D8K3 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Derl3Q9D8K3 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Derl3Q9D8K3 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Derl3Q9D8K3 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Derl3Q9D8K3 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Derl3Q9D8K3 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Derl3Q9D8K3 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Derl3Q9D8K3 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Derl3Q9D8K3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Derl3Q9D8K3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Derl3Q9D8K3 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Derl3Q9D8K3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Derl3Q9D8K3 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Derl3Q9D8K3 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Derl3Q9D8K3 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Derl3Q9D8K3 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Derl3Q9D8K3 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Derl3Q9D8K3 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Derl3Q9D8K3 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Derl3Q9D8K3 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Derl3Q9D8K3 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Derl3Q9D8K3 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Derl3Q9D8K3 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms