Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Alkbh4Q9D8F1 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Alkbh4Q9D8F1 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Alkbh4Q9D8F1 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Alkbh4Q9D8F1 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Alkbh4Q9D8F1 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Alkbh4Q9D8F1 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Alkbh4Q9D8F1 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Alkbh4Q9D8F1 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Alkbh4Q9D8F1 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Alkbh4Q9D8F1 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Alkbh4Q9D8F1 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Alkbh4Q9D8F1 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Alkbh4Q9D8F1 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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