Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Nop56Q9D6Z1 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Nop56Q9D6Z1 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Nop56Q9D6Z1 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Nop56Q9D6Z1 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Nop56Q9D6Z1 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Nop56Q9D6Z1 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Nop56Q9D6Z1 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Nop56Q9D6Z1 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Nop56Q9D6Z1 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nop56Q9D6Z1 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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