Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

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Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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