Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms