Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Snx29Q9D3S3 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Snx29Q9D3S3 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Snx29Q9D3S3 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Snx29Q9D3S3 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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