Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms