Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C1

Ube2c, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2cQ9D1C1 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms