Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Hddc3Q9D114 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Hddc3Q9D114 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hddc3Q9D114 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hddc3Q9D114 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hddc3Q9D114 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hddc3Q9D114 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hddc3Q9D114 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hddc3Q9D114 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Hddc3Q9D114 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hddc3Q9D114 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hddc3Q9D114 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hddc3Q9D114 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hddc3Q9D114 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hddc3Q9D114 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Hddc3Q9D114 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hddc3Q9D114 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hddc3Q9D114 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Hddc3Q9D114 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hddc3Q9D114 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hddc3Q9D114 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hddc3Q9D114 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hddc3Q9D114 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hddc3Q9D114 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hddc3Q9D114 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hddc3Q9D114 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hddc3Q9D114 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hddc3Q9D114 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hddc3Q9D114 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hddc3Q9D114 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hddc3Q9D114 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hddc3Q9D114 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hddc3Q9D114 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Hddc3Q9D114 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Hddc3Q9D114 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Hddc3Q9D114 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hddc3Q9D114 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hddc3Q9D114 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hddc3Q9D114 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hddc3Q9D114 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hddc3Q9D114 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hddc3Q9D114 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hddc3Q9D114 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hddc3Q9D114 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Hddc3Q9D114 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Hddc3Q9D114 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hddc3Q9D114 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hddc3Q9D114 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hddc3Q9D114 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hddc3Q9D114 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hddc3Q9D114 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hddc3Q9D114 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hddc3Q9D114 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hddc3Q9D114 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hddc3Q9D114 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hddc3Q9D114 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hddc3Q9D114 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hddc3Q9D114 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Hddc3Q9D114 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hddc3Q9D114 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hddc3Q9D114 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Hddc3Q9D114 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Hddc3Q9D114 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Hddc3Q9D114 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Hddc3Q9D114 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Hddc3Q9D114 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Hddc3Q9D114 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Hddc3Q9D114 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Hddc3Q9D114 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Hddc3Q9D114 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms