Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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