Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Ccdc47Q9D024 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Ccdc47Q9D024 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc47Q9D024 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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