Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Sgo1Q9CXH7 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
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Sgo1Q9CXH7 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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