Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Ddx28Q9CWT6 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Ddx28Q9CWT6 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Ddx28Q9CWT6 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Ddx28Q9CWT6 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Ddx28Q9CWT6 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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