Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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MINDY3Q9CV28 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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MINDY3Q9CV28 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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MINDY3Q9CV28 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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MINDY3Q9CV28 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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MINDY3Q9CV28 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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MINDY3Q9CV28 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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