Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Ubr1-201ENSMUST00000028728 7768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Acot11-202ENSMUST00000102762 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Celsr3-201ENSMUST00000024238 11547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Als2-201ENSMUST00000027178 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms