Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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