Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms