Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
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