Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
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Rab5aQ9CQD1 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
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Rab5aQ9CQD1 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
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Rab5aQ9CQD1 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
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Rab5aQ9CQD1 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
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Rab5aQ9CQD1 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
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Rab5aQ9CQD1 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
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