Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms