Protein–RNA interactions for Protein: Q99P81

Abcg3, ATP-binding cassette sub-family G member 3, mousemouse

Predictions only

Length 650 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg3Q99P81 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Abcg3Q99P81 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Abcg3Q99P81 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Abcg3Q99P81 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Abcg3Q99P81 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Abcg3Q99P81 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Abcg3Q99P81 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Abcg3Q99P81 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Abcg3Q99P81 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Abcg3Q99P81 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Abcg3Q99P81 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Abcg3Q99P81 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Abcg3Q99P81 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Abcg3Q99P81 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Abcg3Q99P81 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Abcg3Q99P81 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Abcg3Q99P81 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Abcg3Q99P81 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Abcg3Q99P81 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Abcg3Q99P81 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Abcg3Q99P81 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Abcg3Q99P81 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Abcg3Q99P81 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Abcg3Q99P81 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Abcg3Q99P81 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Abcg3Q99P81 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Abcg3Q99P81 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Abcg3Q99P81 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Abcg3Q99P81 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Abcg3Q99P81 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Abcg3Q99P81 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Abcg3Q99P81 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Abcg3Q99P81 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Abcg3Q99P81 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Abcg3Q99P81 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Abcg3Q99P81 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Abcg3Q99P81 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Abcg3Q99P81 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Abcg3Q99P81 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Abcg3Q99P81 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Abcg3Q99P81 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Abcg3Q99P81 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Abcg3Q99P81 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Abcg3Q99P81 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Abcg3Q99P81 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Abcg3Q99P81 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Abcg3Q99P81 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Abcg3Q99P81 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Abcg3Q99P81 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Abcg3Q99P81 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Abcg3Q99P81 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Abcg3Q99P81 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Abcg3Q99P81 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Abcg3Q99P81 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Abcg3Q99P81 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Abcg3Q99P81 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Abcg3Q99P81 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Abcg3Q99P81 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Abcg3Q99P81 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Abcg3Q99P81 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Abcg3Q99P81 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Abcg3Q99P81 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Abcg3Q99P81 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abcg3Q99P81 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Abcg3Q99P81 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abcg3Q99P81 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abcg3Q99P81 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abcg3Q99P81 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abcg3Q99P81 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abcg3Q99P81 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abcg3Q99P81 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abcg3Q99P81 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abcg3Q99P81 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abcg3Q99P81 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Abcg3Q99P81 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abcg3Q99P81 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abcg3Q99P81 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abcg3Q99P81 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abcg3Q99P81 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Abcg3Q99P81 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abcg3Q99P81 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Abcg3Q99P81 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abcg3Q99P81 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Abcg3Q99P81 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abcg3Q99P81 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Abcg3Q99P81 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abcg3Q99P81 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abcg3Q99P81 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abcg3Q99P81 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abcg3Q99P81 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abcg3Q99P81 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abcg3Q99P81 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abcg3Q99P81 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abcg3Q99P81 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abcg3Q99P81 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Abcg3Q99P81 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Abcg3Q99P81 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Abcg3Q99P81 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Abcg3Q99P81 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Abcg3Q99P81 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.4 ms