Protein–RNA interactions for Protein: Q99N92

Mrpl27, 39S ribosomal protein L27, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl27Q99N92 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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