Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Tnnt3-225ENSMUST00000179658 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Olfr1121-201ENSMUST00000062555 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Tnnt3-202ENSMUST00000078497 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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PtprtQ99M80 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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PtprtQ99M80 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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PtprtQ99M80 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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PtprtQ99M80 Tmem208-202ENSMUST00000098453 950 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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PtprtQ99M80 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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PtprtQ99M80 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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PtprtQ99M80 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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PtprtQ99M80 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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PtprtQ99M80 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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PtprtQ99M80 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
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PtprtQ99M80 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 1110020A21Rik-201ENSMUST00000181147 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
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PtprtQ99M80 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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