Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Hps4Q99KG7 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Hps4Q99KG7 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Hps4Q99KG7 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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