Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms