Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms