Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
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Cldn16Q925N4 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
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Cldn16Q925N4 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
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